Конференция является высшим руководящим органом профобъединения, которая созывается советом по мере необходимости, но не реже одного раза в пять лет в сроки, определенные коллегиальными органами ФНПР.

Норму представительства на конференцию устанавливает совет, а порядок избрания делегатов - членские организации.